Diagnòstic de precisió de l’anàlisi d’amplificació isotèrmica mediatitzada en bucle per a la tuberculosi de micobacteri: revisió sistemàtica i metaanàlisi | informes científics

Diagnòstic de precisió de l’anàlisi d’amplificació isotèrmica mediatitzada en bucle per a la tuberculosi de micobacteri: revisió sistemàtica i metaanàlisi | informes científics

Anonim

Temes

  • Biomarcadors
  • Enfermetats infeccioses

Resum

La precisió de la prova diagnòstica de l’anàlisi d’amplificació isotèrmica (LAMP) mediada en bucle per a la tuberculosi demostrada en cultiu no està clara. Hem buscat bases de dades electròniques tant en estudis de control de cohort com en casos que proporcionaven dades per calcular la sensibilitat i l’especificitat. La prova d'índex va ser qualsevol assaig de LAMP incloent tant kits comercialitzats com assajos interns. La M. tuberculosi demostrada en cultiu es considerava una prova de referència positiva. Vam incloure 26 estudis sobre 9330 mostres d’esput i un estudi en 315 exemplars extra-pulmonars. Per a mostres d’esput, 26 estudis van obtenir les estimacions resumides de sensibilitat del 89, 6% (IC del 95% 85, 62, 9, 6%), l’especificitat del 94, 0% (95% CI 91, 0-96, 1%) i una proporció diagnòstica d’odds de 145 (CI 95% 93–226). Nou estudis centrats en Loopamp MTBC van obtenir les estimacions resumides de sensibilitat del 80, 9% (95% CI 76, 0-85, 1%) i especificitat del 96, 5% (95% CI 94, 7-97, 7%). Loopamp MTBC tenia una sensibilitat més alta i una menor especificitat per a espotatge positiu de frotis en comparació amb espota negativa. Els assajos a casa mostraven una sensibilitat més alta i una menor especificitat en comparació amb Loopamp MTBC. LAMP promet ser un test útil per al diagnòstic de tuberculosi, tot i que encara cal millorar el test per fer-lo més senzill, barat i eficaç per fer-lo competitiu enfront d'altres mètodes de PCR ja disponibles.

Introducció

La tuberculosi Mycobacterium (M.) és una malaltia infecciosa que pot afectar la vida que afecta tant la població infectada pel VIH com la no infectada pel VIH. La TB afecta freqüentment als pulmons humans i provoca diversos símptomes com fatiga, tos humida, esput sanguinari i febre persistent. Tot i que la incidència mundial i la prevalença de tuberculosi disminueixen gradualment, s’atribueixen aproximadament 1, 5 milions de morts a l’any a la tuberculosi segons el Banc Mundial i l’Organització Mundial de la Salut 1 . És imprescindible obtenir un diagnòstic de TB exacte per tractar i evitar la propagació de la tuberculosi. La taca i el cultiu àcid-ràpids són exàmens clàssics per la tuberculosi. Tanmateix, la seva precisió de la prova diagnòstica, especialment la sensibilitat pel frotis, no és suficient. El diagnòstic precís de TB per cultiu requereix un llarg temps d’incubació 2, 3 .

Des que es va desenvolupar el 1983, la reacció en cadena de la polimerasa (PCR) ha tingut un paper central en l'amplificació de l'àcid nucleic. Actualment, alguns kits de PCR com Cobas TaqMan i Xpert MTB / RIF estan disponibles comercialment i s'utilitzen àmpliament per al diagnòstic de TB 4, 5 . Tanmateix, el test PCR requereix un ciclista tèrmic car per amplificar el fragment d'ADN en diversos passos depenents de la temperatura. El test d'amplificació isotèrmica (LAMP) mediat en bucle és una altra tècnica d'amplificació d'àcids nucleics. En contrast amb la PCR, el test LAMP pot amplificar una seqüència orientada a una temperatura constant. Per tant, no és necessari un ciclista tèrmic gran i costós per a un assaig LAMP 6, 7 . Un LAMP barat seria especialment acollit en aquelles zones amb escassetat d'equips mèdics. El Brasil, Rússia, l'est asiàtic, el sud d'Àsia, el sud-est asiàtic, el sud-africà i l'est de l'Àfrica tenen una gran càrrega de tuberculosi. Els recursos mèdics són limitats a la majoria d’aquests països 1 . La disponibilitat d’expertesa i tecnologia a l’àrea perifèrica és sempre un problema considerable. La qualitat de qualsevol forma de diagnòstic és encara pitjor als hospitals perifèrics dels països en desenvolupament.

Durant els darrers deu anys, diversos investigadors han valorat la precisió de la prova diagnòstica del test LAMP per a la tuberculosi. Tot i que aquests estudis han revelat un rendiment diagnòstic generalment molt bo, hi ha considerables discrepàncies entre els seus resultats 8.9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32 . A més, cap dels estudis va poder descriure una precisió diagnòstica precisa a causa del seu poder estadístic limitat. Dos grups de recerca van realitzar revisions sistemàtiques i metaanàlisis univariables per estimar la sensibilitat i l’especificitat agrupades 6, 7 . Tot i això, creiem que es necessita una metaanàlisi actualitzada. Això és degut a que aquestes revisions sistemàtiques van indicar resultats discrepants, és a dir, la sensibilitat combinada del 80% i el 93%, i perquè les guies de metaanàlisi recents han suggerit fortament un enfocament de metaanàlisi jeràrquica en lloc de una metaanàlisi simple univariada 33, 34 . L’objectiu de la revisió sistemàtica actual i metaanàlisi és revelar la precisió de la prova diagnòstica del test LAMP per a la tuberculosi mitjançant les dades d’estudis anteriors.

Mètodes

Registre d'estudi

El protocol de l’estudi va seguir el manual de Cochrane per a les revisions de precisió de les proves de diagnòstic i els articles d’informe preferits a la declaració de revisions sistemàtiques i metaanàlisis 34, 35 . Aquest protocol s'ha registrat al registre de prospeccions internacionals de revisions sistemàtiques (PROSPERO) amb el número CRD42016032722 36 .

Criteris d'elegibilitat

Tipus d'estudis

Vam incloure estudis de control de cohorts i casos. Un estudi per a la precisió de les proves diagnòstiques és essencialment de secció transversal. No obstant això, els estudis d'una i dues portes s'anomenen habitualment estudis de cohort i control de casos en aquest camp 33 . Vam considerar que els estudis de control de casos tenien un risc elevat de biaix en la selecció del pacient 37 . Tot i que un article no proporcionava directament la precisió diagnòstica del test LAMP per a TB, si tenia dades suficients per calcular la sensibilitat i l’especificitat, s’hi va incloure.

Després del protocol, no hem exclòs els estudis només a causa d’una descripció que no fos anglesa. El nostre protocol també permetia articles no complets, com ara informes de conferències.

Test d’índex i referència

Es va considerar qualsevol assaig de LAMP dirigit a l’àcid nucleic TB inclosos tant kits comercialitzats com assajos interns com a proves d’índex. Els exemplars han de ser exemplars clínics i no es van acceptar aïllaments de cultiu.

Hem utilitzat com a referència la M. tuberculosi demostrada pel cultiu. A més de M. tuberculosis , altres espècies pertanyents al complex M. tuberculosis , com M. bovis i M. africanum , també van ser considerades com a M. tuberculosis, ja que en situacions clíniques normals, és pràcticament impossible distingir-les de M. tuberculosi 2 .

Estratègia de cerca de literatura

El 28 de desembre de 2015, varem cercar a Pubmed, EMBASE, la Biblioteca Cochrane a Wiley i Web of Science.

Hem utilitzat la fórmula següent per a Pubmed sense cap limitació: (Tuberculosi O TB O micobacteri *) I (LÀMPADA O “amplificació isoterma mediada en bucle”) I (sensibilitat O especificitat O “valor predictiu” O probabilitat O “veritable positiu” O “ veritable negatiu ”O“ fals positiu ”O“ fals negatiu ”). També es van utilitzar fórmules de cerca similars per a Embase, biblioteca Cochrane i Web of Science (Text suplementari 1).

Es van consultar referències de ressenyes publicades anteriorment i d’estudis originals inclosos per a possibles articles candidats.

Selecció i selecció d’estudi

Dos investigadors (KN, NH) van examinar els articles candidats de forma independent comprovant el títol i el resum. Un cop finalitzat el cribratge independent, els investigadors van examinar articles que foren considerats candidats per almenys un investigador per a la seva inclusió final. Les discrepàncies es van resoldre mitjançant discussió entre els dos investigadors.

Extracció de dades

Els dos investigadors van extreure de manera independent la informació necessària dels articles finalment inclosos. A continuació, vam comprovar de forma creuada les dades extretes pels dos investigadors. Les discrepàncies es van resoldre mitjançant discussió entre els dos investigadors.

Els exemplars respiratoris i els exemplars no respiratoris es van tractar per separat. Quan els exemplars respiratoris i no respiratoris es van avaluar col·lectivament en un estudi i no es van poder separar aquestes dades, es van descarregar les dades.

Avaluació de la qualitat per a biaix i aplicabilitat

Els dos investigadors van avaluar de forma independent els set dominis d'una Eina revisada per a l'avaluació de la qualitat dels estudis de precisió diagnòstics (QUADAS-2) 37 . Es va considerar que un estudi que no tenia dominis amb un alt risc de parcialitat i que no tingués dominis amb grans problemes d’aplicabilitat.

Anàlisi estadística

Resultats i síntesi de dades

Primer, es va fer dos per dos contingències a partir del nombre de veritables positius / falsos negatius / falsos positius / veritables negatius presentats en cada estudi original. Aquestes xifres es van comptabilitzar en base a exemplars, no a persones. Per avaluar la precisió general, es va avaluar la proporció de diagnòstic de les probabilitats (DOR) mitjançant el model aleatori DerSimonian-Laird i l’àrea sota les corbes jeràrquiques de les operacions del receptor resum (HSROC) (AUC) mitjançant el model proporcional 38, 39 de Holling . També es va dibuixar una parcel·la forestal aparellada i HSROC, i es va calcular les estimacions resumides de la sensibilitat i l’especificitat mitjançant el model bivarià 33 . La proporció de probabilitat positiva (PLR) i la proporció de probabilitat negativa (NLR) es van estimar a partir de les estimacions resumides de sensibilitat i especificitat 33, 34 . AUC, PLR i NLR van ser interpretats segons el criteri per Grimes et al . i Jones et al . 40, 41 .

Heterogeneïtat

L’heterogeneïtat valorada per l’estadística I 2 es va interpretar de la manera següent: del 0% al 40% no era important, del 30% al 60% va representar heterogeneïtat moderada, del 50% al 90% va representar una heterogeneïtat substancial, del 75% al ​​100% va indicar una heterogeneïtat considerable 42. .

Programari

Hem utilitzat les ordres següents del programari d'estadístiques R: l'ordre "madauni" per a DOR, l'ordre "phm" per a AUC i la comanda "reitsma" per a la corba HSROC i les estimacions de resum de sensibilitat i especificitat 38, 39 .

Anàlisi de sensibilitat

Hem realitzat anàlisis de sensibilitat centrant-nos en informes de gran qualitat, el test intern LAMP i mitjançant el kit comercial de Loopamp MTBC Detection Kit dirigit a DNA gyrB i ADN IS6110 fabricat per EIKEN CHEMICAL CO., LTD. (Loopamp MTBC). L’ús només del Loopamp PURE Extraction DNA Kit no es va comptabilitzar com a Loopamp MTBC. També es va avaluar la precisió de la prova diagnòstica mitjançant dades derivades d’estudis que van obtenir un exemplar d’esput d’algun individu.

Resultats

Recerca d’estudi i característiques de l’estudi

Dels 289 articles candidats, finalment hem identificat 25 articles elegibles que representen 27 estudis independents (Fig. 1).

Image

Hem trobat 70, 72, 133 i 10 articles de bases de dades de Pubmed, Web of Science, EMBASE i Cochrane, respectivament.

Imatge a mida completa

Entre els 27 estudis, 22 van utilitzar l’enfocament de cohort, un va utilitzar l’enfocament de control de casos i quatre no van descriure l’enfocament de contractació; 17 eren articles de llarg termini, nou eren reportatges de conferències, un de tesi; 24 es van escriure en llengua anglesa, tres en llengua japonesa; nou van utilitzar el MTBC Loopamp comercialitzat, 18 avaluats en els assajos LAMP a casa; 26 es van analitzar mostres d’esput, i una es van avaluar mostres extra-pulmonars (taula 1). No s'ha utilitzat cap estudi de mostres respiratòries que no siguin esput, com ara líquid gàstric o rentat bronquial. En particular, un informe de la conferència de l’Organització Mundial de la Salut (OMS) va descriure tres estudis independents 11 . Mentre que, tres eren multinacionals, 24 eren estudis nacionals. Sis eren de cadascun del Japó i de l’Índia, tres eren de cada Xina i Iran i un de cinc països més. Segons la classificació del Banc Mundial, vuit, set, vuit i un eren de països de mitja alta, mitjana-alta, mitjana-baixa i baixa, respectivament. El nombre d’exemplars avaluats en cada estudi va ser del 10 al 1741 amb una mediana de 161, que totalitzava 9645 consistents en 3099 exemplars TB de cultiu positiu i 6546 exemplars negatius del cultiu TB. Sis estudis es consideren de baixa qualitat a causa del disseny de l'estudi de control de casos o l'exclusió inadequada de mostres, mentre que els altres 21 es consideraven estudis d'alta qualitat (Taula 1. Figura suplementària 1).

Taula completa

Exemplar respiratori

En els 26 estudis que van avaluar 9330 mostres d’esput van incloure 3069 exemplars positius de cultiu i es van avaluar 6261 exemplars negatius de cultiu. Aquests estudis van donar sensibilitat en el rang del 68, 7–100, 0% amb una mitjana del 90, 0% i especificitats del 48, 0–100, 0% amb una mediana del 95, 4% (Fig. 2). L’AUC de 0, 962 (interval de confiança del 95% (CI 95%) 0, 949–0, 975) i la DOR de 145 (CI del 95% 93–226, I 2 = 19, 8%) van suggerir una precisió diagnòstica general molt bona (taula 2, fig. 2 i 3A) 41 . Les dades dels 26 estudis van proporcionar la sensibilitat d’estimació resumida del 89, 6% (95% CI 85, 6-92, 6%) i l’especificitat de l’estimació resumida del 94, 0% (95% CI 91, 0-96, 1%). El PLR i el NLR van ser del 14, 9 (95% CI 9, 8-22, 8) i 0, 11 (IC del 95% 0, 08–0, 15), respectivament. Aquests índexs de probabilitat van significar que un resultat de test LAMP positiu va augmentar considerablement la probabilitat de TB provada en cultiu i que un resultat de test negatiu de LAMP va disminuir moderadament la probabilitat 40 .

Image

Imatge a mida completa

Taula completa

Image

La mida dels cercles indica el pes de cada estudi.

Imatge a mida completa

Després d'excloure sis estudis de baixa qualitat, les estadístiques de precisió diagnòstica no van canviar significativament (Taula 2, Fig. 3B).

Basant-se en anàlisis de subgrups dependents de l’assaig, LoBCamp MTBC es va avaluar per nou estudis sobre 5283 mostres d’esput i el assaig LAMP intern es va avaluar mitjançant 17 estudis sobre 4047 mostres d’esput (Taula 2, Fig. 3C, D). Tot i que els assajos interns van utilitzar diversos mètodes d’anàlisi i àcids nucleics objectius, no es va observar heterogeneïtat durant la metaanàlisi de DOR per a assajos interns (I 2 = 0%). No hi va haver una diferència de valor DOR significativa entre els estudis centrats en Loopamp MTBC i els estudis centrats en LAMP interns. No obstant això, l'AUC va ser significativament més gran per als estudis centrats en assajos interns. L'estimació resumida de la sensibilitat dels assajos interns (sensibilitat 93, 0%, CI del 95% 88, 9-95, 7%) va ser superior a la de Loopamp MTBC (sensibilitat 80, 9%, CI 95% 76, 0-85, 1%), mentre que l'estimació resum de l'especificitat per a assajos interns (especificitat 91, 8%, IC del 95% 86, 4-95, 1%) era inferior a Loopamp MTBC (especificitat 96, 5%, 95% CI 94, 7-97, 7%).

Quatre estudis van proporcionar dades sobre la precisió de la prova diagnòstica de Loopamp MTBC per a exemplars positius de frotis i negatius per separat. Per als esputes positius amb frotis, el test d’Eiken va produir una sensibilitat de l’estimació resumida del 96, 6% (95% CI 90, 4-98, 8%) i una especificitat del 71, 3% (95% CI 37, 1-191, 3%). Aquestes estimacions sumàries van resultar en PLR de 3, 4 (95% CI 1, 5–11, 1) i NLR de 0, 05 (95% CI 0, 02–0, 16) (Taula 2, Fig. 3E). Per a l'espota negativa amb frotis, el test d'Eiken va conduir a la sensibilitat de l'estimació resumida del 54, 3% (95% CI 34, 7-72, 6%) i l'especificitat del 98, 6% (95% CI 97, 3–99, 1%), que va obtenir un PLR de 38, 8 (95% CI 19, 3–72, 5) i RMN de 0, 46 (95% CI 0, 28–0, 66) (Taula 2 Fig. 3F). Aquestes estimacions sumàries de sensibilitat i especificitat (Fig. 4) es van estimar a partir de les estimacions sumàries de la PPV i dels VPH.

Image

PPV: valor predictiu positiu. VANV: valor predictiu negatiu. PoTP: valor predictiu post-test. La xifra es va obtenir en funció de la sensibilitat de 0, 966 i l’especificitat de 0, 713 per a mostres d’esput netejar-positives i de la sensibilitat de 0, 543 i d’especificitat de 0, 986 per a mostres d’esput negatiu. La probabilitat prèvia a la prova té un significat similar a la prevalença. Els lectors poden simplement introduir la prevalença al país o àrea en la probabilitat prèvia a la prova. Per exemple, a la zona de prevalença del 5%, la probabilitat prèvia a la prova pot ser del 5% per a la configuració del cribratge. Tanmateix, si es disposa d’informació clínica, es prefereix la probabilitat prèvia a la prova específica del pacient. Per exemple, la probabilitat prèvia a la prova pot ser del 50% per a pacients amb febre crònica, antecedents de contacte amb la tuberculosi i una cavitació en radiografia fins i tot en una zona amb prevalença del 5%.

Imatge a mida completa

Com a anàlisi de sensibilitat, es va avaluar la precisió de la prova diagnòstica mitjançant dades derivades d’estudis que van obtenir un exemplar d’esput d’algun individu. Això va proporcionar DOR de 130 (IC del 95% 73–231) i AUC de 0, 958 (95% CI 0, 939–0, 979), que són compatibles amb les obtingudes de les dades de 26 estudis amb esput (Taula 2G).

Exemplar extra-pulmonar

Només un estudi de Joon et al . va avaluar la precisió de la prova diagnòstica del test Loopamp MTBC per TB provada en cultiu mitjançant exemplars extra-pulmonars. Aquest estudi va valorar 315 exemplars extra-pulmonars incloent sang, orina, gangli limfàtic i una varietat de líquids corporals (Fig. 2). Van revelar un DOR de 159 (95% CI 36–712), AUC de 0, 961, una sensibilitat d’estimació resumida del 93, 3% (95% CI 77, 9-99, 2%) i una estimació resumida d’especificitat del 91, 9% (95% CI 88, 1–94, 8%) (taula 2).

Discussió

Hem revisat sistemàticament la precisió diagnòstica del test LAMP per a la tuberculosi provada en cultiu. A jutjar del DOR i de la AUC, la precisió diagnòstica del test LAMP va ser molt bona tant per als esputs com per als exemplars no respiratoris 41 . No obstant això, la seva precisió de les proves diagnòstiques era més pobra que la dels assajos de PCR com Xpert i Cobas TaqMan 4, 5, 43 . Utilitzant mostres d’esput, el test LAMP va proporcionar la sensibilitat d’estimació resumida del 89, 6% i l’especificitat del 94, 0%. No es va observar cap discrepància significativa entre les precisions de les proves entre esputa i exemplars extra-pulmonars (taula 2). La robustesa del nostre resultat va ser recolzada per nombrosos factors. Primer es va realitzar una cerca d’estudi atenta. Yuan et al . va informar el 2014 d’una revisió sistemàtica sobre el mateix tema, que finalment va incloure 10 articles amb 1920 exemplars 6 . Una revisió sistemàtica publicada recentment per Yan et al . va incloure nou articles amb 2971 mostres d'esputum 7 . Per contra, vam poder incloure fins a 26 estudis amb 9285 exemplars gràcies a la nostra cerca cerca d’estudis. Aquest gran nombre d’estudis i exemplars inclosos va millorar la credibilitat de la nostra anàlisi. En segon lloc, a través de les nostres metaanàlisis, no hem trobat una forta heterogeneïtat (I 2 <30%). En tercer lloc, les anàlisis de sensibilitat van revelar de forma constant una capacitat de diagnòstic global similar. En quart lloc, es va utilitzar el model jeràrquic recomanat actualment en lloc de la metaanàlisi univariada. A més, la força de l’estudi actual és que hem obtingut una precisió diagnòstica centrada en el estat de Loopamp MTBC i l’estat de frotis.

L’amplificació de l’àcid nucleic mostra diferents característiques diagnòstiques depenent de l’estat de frotis (taula 2, figs 3 i 4) 5 . Per tant, hem d’interpretar el resultat mitjançant l’assaig LAMP combinat amb el resultat de l’estat del frotisme. Per als exemplars negatius de frotis, un assaig LAMP positiu va augmentar molt la probabilitat de TB provada en cultiu i es pot reconèixer com a examen de regla. Tot i això, un assaig LAMP negatiu no va poder afegir informació essencial sobre exemplars negatius de frotis. Un assaig de PCR també mostra freqüentment un resultat fals negatiu per a una espota frotable-negativa, de manera que la precisió de la prova diagnòstica de l’assaig LAMP per a l’espota negativa de frotis és gairebé comparable a la de PCR 5 . Per als exemplars positius de frotis, un assaig LAMP negatiu va disminuir molt la probabilitat de TB. Tanmateix, a causa dels resultats freqüents dels assajos de LAMP falsos positius per a esputa frotal-positiva, un LAMP positiu per a una esputa positiva de frotis no va afectar gaire la probabilitat de TB. Són coneguts els factors de risc de temperatura elevada, humitat i volum inadequat de reactius per obtenir resultats falsos positius. Aquest assaig produeix una gran quantitat d’ADN, que sovint s’escampa a l’aire lliure. Això pot causar contaminació creuada en el test posterior. A més, Loopamp MTBC també pot reaccionar creuadament amb l'ADN 11 humà. Per minimitzar el risc de falsos positius, cal una formació completa dels tècnics de laboratori.

Loopamp MTBC, que és l’únic kit LAMP comercialitzat per a TB, no té el suport de l’OMS 11 . Entre 27 estudis inclosos, només nou van avaluar el Loopamp MTBC i els altres 18 avaluar els assajos LAMP a casa. No és molt difícil dissenyar primers imprimors LAMP originals, per la qual cosa els investigadors sovint intenten crear el seu assaig original LAMP. En comparació amb Loopamp MTBC, el test intern LAMP va mostrar una sensibilitat més alta i una menor especificitat (Taula 2, Fig. 3). Tanmateix, l’alt rendiment d’assaig intern és potencialment recolzat pel biaix introduït per una major destresa i recursos abundants en laboratoris qualificats que poden realitzar un assaig original de LAMP en comparació amb els laboratoris perifèrics que van participar en moltes investigacions de camp del kit comercialitzat. El test de TB LAMP s’aplica generalment a pacients amb sospita de TB i rarament s’utilitza amb finalitats de cribratge. Per reglar en el diagnòstic TB, l’especificitat és més important que la sensibilitat. Per tant, els assajos interns reportats generalment no són atractius. Quan es dissenyi un assaig LAMP nou per a TB, es preferirà un assaig amb alta especificitat.

Hi ha varietat d’exàmens per detectar TB, per la qual cosa els metges han de seleccionar l’estratègia diagnòstica òptima segons la probabilitat prèvia a la prova de TB estimada a partir de les característiques del pacient i la prevalença de TB a la zona. A més, s'han de tenir en compte els problemes pressupostaris tant dels pacients com del govern local. Tot i que els assajos de PCR són els millors exàmens disponibles actualment 11, el LAMP està sent acceptat com a prova alternativa als països amb recursos. En la nostra revisió sistemàtica anterior sobre la PCR en temps real de Cobas TaqMan MTB, 13 de 17 estudis es van informar de països d’ingressos alts mitjançant els criteris del Banc Mundial 5 . En canvi, només nou de cada 27 estudis de la revisió sistemàtica actual del test LAMP procedien de països amb ingressos alts (taula 1). Actualment, l’OMS recomana l’ús del test PCR MTB / RIF PCR per comprovar la resistència a la rifampicina fins i tot en els laboratoris perifèrics 11, 43 . Tot i que generalment entenem l’avantatge de Xpert MTB / RIF sobre el LAMP, molts laboratoris perifèrics en zona endèmica d’alta tuberietat amb infraestructures limitades i recursos mèdics no es poden permetre a Xpert MTB / RIF 44 . LAMP podria substituir Xpert MTB / RIF a la zona perifèrica de baixos ingressos on no prevalgui la tuberculosi resistent a diversos medicaments, tot i que els metges han de considerar atentament el resultat de la frotació de l’esput i de l’epidemiologia, especialment pel que fa a la resistència als medicaments, a la zona 5, 45 . Actualment, ni LAMP ni Xpert són l’eina ideal per a configuracions perifèriques.

El nostre estudi té algunes limitacions. Primer, alguns dels estudis inclosos presentaven un risc de parcialitat a causa del seu disseny d'estudi. Tot i això, fins i tot després d’excloure els estudis d’alt risc, la precisió estimada de la prova no va canviar. En segon lloc, els estudis sobre assajos interns van avaluar diversos assajos. No obstant això, la metaanàlisi sobre assajos interns no va mostrar heterogeneïtat. Creiem que aquests defectes no afecten la solidesa de la nostra anàlisi. En tercer lloc, la nostra anàlisi no respon directament a la precisió de la prova diagnòstica del test LAMP per a alguns paràmetres específics, és a dir, pacients positius amb VIH, tuberculosi resistent a fàrmacs, casos infantils i casos sospitosos de micobacterium no TB. En quart lloc, alguns estudis inclosos van utilitzar mostres múltiples d’un individu. Tot i que aquesta matèria pot comportar un biaix del resultat de l’anàlisi, l’anàlisi de sensibilitat centrada en estudis que van avaluar un exemplar d’un pacient va garantir la nostra anàlisi global (taula 2). Per últim, hi ha qui pensa que el nostre mètode de cerca d’estudi no era prou sensible, tot i que creiem que l’estratègia de cerca equilibra bé la sensibilitat i l’especificitat.

En conclusió, es va realitzar una revisió sistemàtica i metaanàlisi mitjançant metodologia sòlida per revelar la precisió de la prova diagnòstica precisa del test LAMP per a la tuberculosi. Incloem gairebé tres vegades més estudis que les revisions sistemàtiques anteriors. Una anàlisi de sensibilitat va assegurar que els nostres resultats eren sòlids. Tot i que la precisió de la prova diagnòstica del test LAMP és molt bona, encara és més pobra que la dels assajos de PCR. En comparació amb Loopamp MTBC, el LAMP intern mostrava una sensibilitat més alta i una menor especificitat. Les característiques de diagnòstic eren molt diferents, depenent de l’estat del frotis. Creiem que l’ús del assaig LAMP combinat amb l’estat de frotis és una estratègia de diagnòstic acceptable sobretot en zones limitades de recursos. Tot i això, encara cal millorar el test per fer-lo més senzill, barat i eficaç per fer-lo competitiu enfront d'altres mètodes de PCR ja disponibles.

Informació adicional

Com citar aquest article : Nagai, K. et al . Precisió de la prova diagnòstica de l’anàlisi d’amplificació isotèrmica mediada en bucle per a Mycobacterium tuberculosis: revisió sistemàtica i metaanàlisi. Cci. Rep. 6, 39090; doi: 10.1038 / srep39090 (2016).

Nota de l’editor: Springer Nature continua sent neutre pel que fa a reclamacions jurisdiccionals en mapes publicats i afiliacions institucionals.

Informació complementària

Documents de paraula

  1. 1.

    Informació complementària

Comentaris

En enviar un comentari, accepteu complir els nostres Termes i Directrius de la Comunitat. Si trobeu alguna cosa abusiva o que no compleix els nostres termes o directrius, marqueu-la com a inadequada.